Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC84Q86UT8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC84Q86UT8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC84Q86UT8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC84Q86UT8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms