Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms