Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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