Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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