Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms