Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC41PQ6P2S7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms