Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms