Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms