Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRAMD4Q6IC98 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms