Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SAMD13Q5VXD3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SAMD13Q5VXD3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SAMD13Q5VXD3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SAMD13Q5VXD3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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