Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms