Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms