Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms