Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms