Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms