Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KRTAP21-3Q3LHN1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KRTAP21-3Q3LHN1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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