Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C17orf58Q2M2W7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C17orf58Q2M2W7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C17orf58Q2M2W7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C17orf58Q2M2W7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C17orf58Q2M2W7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C17orf58Q2M2W7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C17orf58Q2M2W7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms