Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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