Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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