Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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