Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PRR4Q16378 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PRR4Q16378 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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