Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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