Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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