Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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