Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
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