Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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