Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SPIDRQ14159 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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