Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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