Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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