Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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