Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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