Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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UBE2V1Q13404 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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