Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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