Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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