Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF3Q13114 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF3Q13114 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF3Q13114 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF3Q13114 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF3Q13114 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF3Q13114 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF3Q13114 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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