Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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