Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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