Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FOXF2Q12947 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FOXF2Q12947 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXF2Q12947 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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