Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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