Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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GRIN2AQ12879 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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GRIN2AQ12879 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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GRIN2AQ12879 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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GRIN2AQ12879 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
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GRIN2AQ12879 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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