Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROQ12816 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROQ12816 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROQ12816 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROQ12816 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROQ12816 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROQ12816 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROQ12816 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROQ12816 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TROQ12816 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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