Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF5Q12774 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms