Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms