Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms