Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms