Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms