Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms