Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms