Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms