Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms